Ia kemudian memutuskan untuk membantu pasukan Romawi dengan menggunakan senjata modernnya.
Ia berharap bisa mengubah sejarah dengan membuat Romawi menaklukkan dunia.
Indiana Jones dan kawan-kawan harus berjuang melawan Voller dan pasukan Romawi sambil mencari cara untuk kembali ke masa kini.
Mereka juga harus melindungi Archimedes dan Dial of Destiny dari jatuh ke tangan yang salah.
Di akhir film, Indiana Jones berhasil merebut kembali setengah bagian Dial of Destiny dari Voller dan menyatukannya dengan setengah bagian milik Helena.
Ia kemudian menggunakan alat tersebut untuk membuka portal waktu kembali.
Namun, sebelum ia bisa masuk ke portal, ia terluka parah akibat serangan Voller.
Helena ingin membawa Indiana Jones kembali ke masa kini, tetapi Indiana Jones menolak. Ia mengatakan bahwa ia ingin mati di masa lalu, di tengah sejarah yang hidup.
Indiana Jones kemudian bertemu dengan Archimedes, yang mengucapkan terima kasih kepadanya atas bantuannya.
Archimedes juga memberikan pesan terakhirnya kepada Indiana Jones, yaitu “Eureka!”.
Indiana Jones tersenyum dan mengucapkan selamat tinggal kepada Helena dan Sallah.
Ia kemudian menutup matanya dan meninggal dengan damai. Helena dan Sallah pun masuk ke portal waktu dan kembali ke masa kini.
Film ini berakhir dengan adegan di makam Indiana Jones, di mana Helena dan Sallah memberikan penghormatan terakhir kepada sang arkeolog.
