Pondok Pesantren Zainul Hasan, Genggong, Probolinggo (1839)
Pondok Pesantren Al-Hikamus Salafiyah, Cipulus, Purwakarta (1840)
Pondok Pesantren Al-Fauzan, Garut (1850)
Pondok Pesantren Langitan, Tuban (1852)
Pondok Pesantren al-Ittihad Poncol, Semarang (1893)
Pondok Pesantren MIS (Ma’hadul Ilmi Asy-Syar’i), Sarang, Rembang (1859)
Pondok Pesantren Syaikhona Kholil, Bangkalan (1861)
Pondok Pesantren Giri Kusumo, Mranggen, Demak (1868)
Pondok Pesantren Arriyadl, Ringinagung, Pare, Kediri (1870)
Pondok Pesantren Tarbiyatun Nasyiin, Pacul Gowang (1880)
Pondok Pesantren Besuk Kejayan Pasuruan (1881)
Pondok Pesantren Sukamiskin, Bandung (1881)
Pondok Pesantren Al-Ashriyah, Genteng, Banyuwangi (1882)
Pondok Pesantren Roudatul Mubtadi’in, Balekambang, Jepara (1884)
Pondok Pesantren Darul Ulum, Peterongan, Jombang (1885)
Pondok Pesantren Al-Ihsan, Jampes, Kediri (1886)
Pondok Pesantren Annuqayah, Guluk-Guluk, Sumenep (1887)
Pondok Pesantren Darul Hikam, Bendo, Pare, Kediri (1889)
Pondok Pesantren Tarbiyatut Tholabah, Lamongan (1898)
Pondok Pesantren Tebuireng, Jombang (1899)
Pondok Pesantren Gedongsari, Nganjuk (1901)
Pondok Pesantren Al-Falak Pagentongan, Bogor (1901)
Pondok Pesantren Al-Fatah, Banjarnegara (1901)
Pondok Pesantren Futuhiyah, Mranggen, Demak (1905)