Selain Japek II, Jasa Marga juga bakal mengoperasikan secara fungsional jalan tol lainnya, yakni yang kedua jalan fungsional Ruas Solo – Yogyakarta (arus mudik & balik) dari Colomadu s.d Jl Sawit (+ 6 km), dengan rute mudik & balik Keluar/Masuk GT Colomadu (Ruas Solo Ngawi) yang dimulai masuk ke ruas fungsional Solo Yogya Keluar ke Jalan Sawit (800 m) Masuk ke Jalan Nasional Solo – Yogya.
Selain itu ada juga jalan tol fungsional Akses KM 99 Cipularang dan fungsional Akses Keluar Darurat KM 149 Padaleunyi.