Menurut Trunoyudo, kepemilikan dan penggunaan senjata oleh Mustopa merupakan bagian dari upaya penyelidikan kejahatan yang dilakukan oleh Polda Metro Jaya secara ilmiah. Tim penyelidik sedang mencari bukti untuk memperjelas motif di balik penembakan ke kantor MUI tersebut.
Trunoyudo menjelaskan bahwa salah satu bukti kuat yang dapat membantu proses Scientific Crime Investigation adalah hasil autopsi jenazah dan beberapa barang bukti dari laboratorium forensik.