Nama Ganjel Rel yang digunakan konon ada beberapa pendapat,
Pertama dikarenakan bentuk roti yang mirip dengan penahan rel kereta api atau dalam bahasa Jawa disebut ‘ganjel rel’.
Pendapat lain menyebutkan penamaan Ganjel Rel dari penyempurnaan sebutan orang-orang di zaman dahulu yang biasa disebut “ganjril”.